193 sayılı Gelir Vergisi Kanunu’nun (3946 sayılı Kanunun 22.maddesi ve 93/5148 sayılı Kararla değişen şekli) 94. maddesinde; “Kamu idare ve müesseseleri, iktisadi kamu müesseseleri, sair kurumlar, ticaret şirketleri, iş ortaklıkları, dernekler, vakıflar, dernek ve vakıfların iktisadi işletmeleri, kooperatifler, yatırım fonu yönetenler, gerçek gelirlerini beyan etmeye mecbur olan ticaret ve serbest meslek erbabı, zirai kazançlarını bilanço veya zirai işletme hesabı esasına göre tespit eden çiftçiler aşağıdaki bentlerde sayılan ödemeleri (avans olarak ödenenler dahil) nakden veya hesaben yaptıkları sırada istihkak sahiplerinin gelir vergilerine mahsuben tevkifat yapmaya mecburdurlar” hükmü yer almıştır.
Bu maddeden de anlaşılacağı üzere, gelir vergisi kesintisi gelir vergisi mükelleflerinin gelir vergilerine mahsuben yapılmaktadır. Vakıflar Bölge Müdürlüğü Katma Bütçeli İdare olduğundan gelir vergisi mükellefiyeti bulunmamaktadır.
.